高密度脂蛋白（HDL）与低密度脂蛋白（LDL）相反，是抗动脉粥样硬化脂蛋白。HDL-C水平低常常与TG中度升高、小而密LDL颗粒共同存在某些患者中，见于2型糖尿病、胰岛素抵抗、腹型肥胖、混合型高脂血症患者、肝肾功能不全、自身免疫病患者。大量的流行病资料表明，血清HDL-C水平与冠心病发病呈负相关，血清HDL-C每增加0.4mmol/L（15mg/dl），则冠心病危险性降低2%～3%。当HDL-C<1.04mmol/L（40mg/dl）的人群与HDL-C≥1.55mmol/L（60mg/dl）的人群相比，缺血性心血管病危险增加50%，并具有显著统计学意义。HDL-C水平降低是动脉粥样硬化发生发展的危险因素，HDL-C水平降低与冠心病和心肌梗死危险增加相关，HDL-C含量低是心血管病风险增加的独立危险因素，因此将HDL-C也加入了新的SCORE心血管危险评分表中。CRUSADE研究中检测 24 805例非ST段抬高型心肌梗死患者入院时HDL-C水平与全因死亡率及心肌梗死再发率的关系。结果显示，极低水平HDL-C组（<30mg/dl）远期死亡风险明显高于正常水平组，40mg/dl以下每降低5mg/dl则死亡风险及其与心肌梗死复发的复合风险均增加5%。一项回顾性观察性队列研究分析2型糖尿病患者因冠心病或卒中住院的风险与HDL-C水平变化的关系，2001年至2006年入选30 067例患者，间隔6～24个月两次测量HDL-C水平，并继续随访3年，最长8年，HDL-C每升高5mg/dl，则心血管病风险降低4%，将其变化分为三组，比起HDL-C值稳定（变化在6.4mg/dl之内）组，降低值>6.5mg/dl组心血管病住院风险升高11%，升高值>6.5mg/dl组则心血管病风险降低8%。因此阻止HDL胆固醇降低对于心血管病一二级预防理论上均是非常重要的策略。

然而，HDL-C极度升高并不一定都对心血管病有保护性作用，还有可能增加心血管风险。Costacou等研究1型糖尿病患者HDL-C及其组分与冠心病的关系，该研究入选1型糖尿病而无冠心病的患者，平均年龄27.1岁，测定HDL-C和HDL3-C，随访18年，29.5%男性和25.5%女性发生了冠心病，HDL3胆固醇水平与冠心病呈现U形关系，即 低于47mg/dl 和高于80mg/ dl患者发生率高于中间水平的患者。HDL家族分为大颗粒HDL，中等颗粒HDL，小颗粒HDL三种亚型。前两种亚型具有抗动脉粥样硬化作用，而小颗粒HDL亚型是否存在致动脉粥样硬化作用尚在研究中。Oravec等研究发现高血压和冠心病患者的血浆脂蛋白中大颗粒HDL含量明显低于对照组，小颗粒HDL含量明显高于对照组，指出小颗粒HDL有可能代表着HDL家族中致动脉粥样硬化的亚型。这可能是未来研究HDL的重要方向。